Научная программа

Общее расписание конференции:

21 июля 22 июля 23 июля 24 июля 25 июля
Утро Геномика эукариот

(9:00)

Метагеномика

(9:00)

NGS и анализ данных

(9:00)

——————

Постерная сессия

Медицинская геномика

(9:00)

——————

Закрытие

После обеда Открытие

(16:00)

Геномика бактерий и вирусов
Культурная программа Банкет

(19:00)

Зоопарк Балет Геологический музей

Фуршет

 

Программа конференции (PDF)

21 июля

16:00 Открытие конференции (малый зал Дома Ученых)

16:15 Концерт

16:45 Fungal genomics for Energy and Environment. Игорь Григорьев, DOE Joint Genome Institute, США

17:15 Sequencing sample prep and data assembly methods: 15 years of accelerated evolution. Марта Матвиенко, CLC Bio, США
22 июля

Геномика эукариот

  • Константин Крутовский (Georg-August-University of Göttingen, Германия)
    Targeted and complete genome de novo sequencing in conifer trees with giant and complex genomes
  • Matthias Meyer (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
    Archaic Genomes
  • Анча Баранова (George Mason University, USA)
    We know it all: what is next? Protein-centric analysis of publicly available PPI data for functionally diverse KCTD family as an example
  • Александр Графодатский (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
    Chromosomal organization of mammalian genomes
  • Анна Дружкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
    Изучение ДНК костных останков рода Equus из Денисовой пещеры с использованием современных платформ для секвенирования
  • Алексей Москалев (Институт биологии Коми НЦ УрО РАН, Сыктывкар)
    Изменение транскриптомов имаго Drosophila melanogaster при воздействии гамма-излучений, 2,3,7,8-тетрахлородибензо-p-диоксина, толуола и формальдегида
  • Фатима Смагулова (European University of Brittany, Франция)
    Картирование горячих точек рекомбинаци в геноме мышей
  • Лосева Екатерина (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
    Функциональная значимость фрагментов генома, генерируемых в результате апоптоза
  • Владимир Трифонов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
    Изучение эволюции половых хромосом рептилий с помощью высокопроизводительного секвенирования хромосомспецифичных библиотек
  • Виктория Миронова  (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
    Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней  Arabidopsis thaliana L.
  • Дмитрий Алексеев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Геном и транскриптом хиромониды P. Vanderplanki
  • Berthold Heinze (Federal Research Centre for Forests, Austria)
    Next-generation alternatives for sequencing many genes in many forest tree individuals
  • Юрий Орлов (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
    Computer analysis of 3D chromosome contacts in cell nucleus revealed by high-throughput sequencing: Hi-C and ChIA-PET technologies

23 июля

Метагеномика

  • Людмила Чистосердова (University of Washington, США)
    Using Metagenomics for understanding functionality of complex microbial communities
  • Евгений Андронов (Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург)
    Новые подходы в анализе почвенной микробиоты по данным высокопризводительного секвенирования ампликонных библиотек.
  • Анна Попенко (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Особенности микробиоты кишечника российской популяции: функциональный анализ и межнациональное сравнение.
  • Александр Зеленин (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Структура бактериального сообщества пищеварительного тракта криптобиотической хирономиды Polypedilum vanderplanki с позиции метагеномного анализа.
  • Виталий Кадников (Центр «Биоинженерия» РАН, Москва)
    Метагеномный анализ микробного сообщества глубинного подземного термального местообитания в Западной Сибири.
  • Александр Тяхт (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Метагеномное исследование временной эволюции состава микробиоты кишечника в ходе курса противораковой терапии у детей.
  • Борис Коварский (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Analysis of genetic variety of human gut metagenome.

Геномика бактерий и вирусов

  • Николай Равин (Центр «Биоинженерия» РАН, Москва)
    Секвенирование геномов экстремофильных микроорганизмов — представителей новых филогенетических линий
  • Константин Мирошников  (Институт биоорганической химии РАН, Москва)
    Перспективы NextGen секвенирования в геномике бактериофагов
  • Ольга Аверина  (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва)
    Полногеномное секвенирование Bifidobacterium longum GT-15: сравнительный геномный анализ, глобальные регуляторные гены, уникальные гены
  • Александр Манолов (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Cборка de-novo и сравнительный анализ генома бактерии p. stutzeri kos6, извлеченной из нефтяного шламма
  • Иван Бодоев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Секвенирование и de-novo сборка геномной ДНК штамма Neisseria gonorrhoeae k51.05

24 июля

NGS и анализ данных

  • Алла Лапидус (ЦГБ СПБГУ, Санкт-Петербург)
    Genome assembly and finishing — why hight quality references are needed
  • Андрей Пржибельский (Санкт-Петербургский Академический университет, Санкт-Петербург)
    Genome draft assembly algorithms: from the very beginning till present-day problems
  • Marie-Theres Gansauge (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
    Methods for ancient DNA sequencing
  • Елена Кострюкова (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
    Влияние этапа пробоподготовки на результаты метагеномного анализа в формате shotgun-секвенирования
  • Игорь Морозов (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
    The importance of library fragments size for the quality of emulsion PCR dependent MPSS data
  • Дмитрий Штокало (Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск)
    Very long intergenic non-coding RNA (vlincRNA) discovery in NGS data
  • Ольга Голосова  (НЦИТ «УНИПРО», Новосибирск)
    Анализ данных высокопроизводительного секвенирования с использованием UGENE.
  • Федор Колпаков (Конструкторско-технологический институт вычислительной техники CО РАН, Новосибирск)
    BioUML – software platform for analysis of next generation sequencing data using collaborative and reproducible research
  • Денис Дмитриенко (Диаэм, Москва)
    Новые инструменты для создания геномных библиотек
  • Дарья Смирнова (Хеликон, Москва)
    Методы высокопроизводительного целевого обогащения участков ДНК для последующего NGS секвенирования

25 июля

Медицинская геномика

  • Вадим Степанов (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
    Высокопроизводительное генотипирование SNP: деканализация иммунного ответа при расселении современного человека
  • Дмитрий Барякин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
    Короткие некодирующие РНК плазмы крови человека
  • Анна Савельева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
    Состав рибонуклеиновых кислот внеклеточных везикул крови здорового человека.
  • Екатерина Трифонова (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
    Выявление патофизиологических механизмов преэклампсии методом полногеномного анализа экспрессии
  • Мария Назаренко (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
    Использование микрочиповых технологий для оценки уровня метилирования ДНК тканей сосудистой стенки и лейкоцитов периферической крови у больных атеросклерозом
  • Ольга Сайк  (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
    Анализ численной экспрессии генов по данным RNA-Seq для расширения «ассоциома» заболевания, реконструированного на основе информации из баз данных.
  • Florian Graedler  (Illumina, Netherlands)
    From Cancer to NIPT — NGS technology in clinical applications.
  • Павел Натальин (Life Technologies, Москва)
    Высокопроизводительное секвенирование для фундаментальной науки и медицины