Общее расписание конференции:
| 21 июля | 22 июля | 23 июля | 24 июля | 25 июля | |
| Утро | Геномика эукариот
(9:00) |
Метагеномика
(9:00) |
NGS и анализ данных
(9:00) —————— Постерная сессия |
Медицинская геномика
(9:00) —————— Закрытие |
|
| После обеда | Открытие
(16:00) |
Геномика бактерий и вирусов | |||
| Культурная программа | Банкет
(19:00) |
Зоопарк | Балет | Геологический музей
Фуршет |
Программа конференции (PDF)
21 июля
16:00 Открытие конференции (малый зал Дома Ученых)
16:15 Концерт
16:45 Fungal genomics for Energy and Environment. Игорь Григорьев, DOE Joint Genome Institute, США
17:15 Sequencing sample prep and data assembly methods: 15 years of accelerated evolution. Марта Матвиенко, CLC Bio, США
22 июля
Геномика эукариот
- Константин Крутовский (Georg-August-University of Göttingen, Германия)
Targeted and complete genome de novo sequencing in conifer trees with giant and complex genomes - Matthias Meyer (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
Archaic Genomes - Анча Баранова (George Mason University, USA)
We know it all: what is next? Protein-centric analysis of publicly available PPI data for functionally diverse KCTD family as an example - Александр Графодатский (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
Chromosomal organization of mammalian genomes - Анна Дружкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
Изучение ДНК костных останков рода Equus из Денисовой пещеры с использованием современных платформ для секвенирования - Алексей Москалев (Институт биологии Коми НЦ УрО РАН, Сыктывкар)
Изменение транскриптомов имаго Drosophila melanogaster при воздействии гамма-излучений, 2,3,7,8-тетрахлородибензо-p-диоксина, толуола и формальдегида - Фатима Смагулова (European University of Brittany, Франция)
Картирование горячих точек рекомбинаци в геноме мышей - Лосева Екатерина (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
Функциональная значимость фрагментов генома, генерируемых в результате апоптоза - Владимир Трифонов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
Изучение эволюции половых хромосом рептилий с помощью высокопроизводительного секвенирования хромосомспецифичных библиотек - Виктория Миронова (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L. - Дмитрий Алексеев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Геном и транскриптом хиромониды P. Vanderplanki - Berthold Heinze (Federal Research Centre for Forests, Austria)
Next-generation alternatives for sequencing many genes in many forest tree individuals - Юрий Орлов (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
Computer analysis of 3D chromosome contacts in cell nucleus revealed by high-throughput sequencing: Hi-C and ChIA-PET technologies
23 июля
Метагеномика
- Людмила Чистосердова (University of Washington, США)
Using Metagenomics for understanding functionality of complex microbial communities - Евгений Андронов (Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург)
Новые подходы в анализе почвенной микробиоты по данным высокопризводительного секвенирования ампликонных библиотек. - Анна Попенко (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Особенности микробиоты кишечника российской популяции: функциональный анализ и межнациональное сравнение. - Александр Зеленин (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Структура бактериального сообщества пищеварительного тракта криптобиотической хирономиды Polypedilum vanderplanki с позиции метагеномного анализа. - Виталий Кадников (Центр «Биоинженерия» РАН, Москва)
Метагеномный анализ микробного сообщества глубинного подземного термального местообитания в Западной Сибири. - Александр Тяхт (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Метагеномное исследование временной эволюции состава микробиоты кишечника в ходе курса противораковой терапии у детей. - Борис Коварский (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Analysis of genetic variety of human gut metagenome.
Геномика бактерий и вирусов
- Николай Равин (Центр «Биоинженерия» РАН, Москва)
Секвенирование геномов экстремофильных микроорганизмов — представителей новых филогенетических линий - Константин Мирошников (Институт биоорганической химии РАН, Москва)
Перспективы NextGen секвенирования в геномике бактериофагов - Ольга Аверина (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва)
Полногеномное секвенирование Bifidobacterium longum GT-15: сравнительный геномный анализ, глобальные регуляторные гены, уникальные гены - Александр Манолов (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Cборка de-novo и сравнительный анализ генома бактерии p. stutzeri kos6, извлеченной из нефтяного шламма - Иван Бодоев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Секвенирование и de-novo сборка геномной ДНК штамма Neisseria gonorrhoeae k51.05
24 июля
NGS и анализ данных
- Алла Лапидус (ЦГБ СПБГУ, Санкт-Петербург)
Genome assembly and finishing — why hight quality references are needed - Андрей Пржибельский (Санкт-Петербургский Академический университет, Санкт-Петербург)
Genome draft assembly algorithms: from the very beginning till present-day problems - Marie-Theres Gansauge (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
Methods for ancient DNA sequencing - Елена Кострюкова (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Влияние этапа пробоподготовки на результаты метагеномного анализа в формате shotgun-секвенирования - Игорь Морозов (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
The importance of library fragments size for the quality of emulsion PCR dependent MPSS data - Дмитрий Штокало (Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск)
Very long intergenic non-coding RNA (vlincRNA) discovery in NGS data - Ольга Голосова (НЦИТ «УНИПРО», Новосибирск)
Анализ данных высокопроизводительного секвенирования с использованием UGENE. - Федор Колпаков (Конструкторско-технологический институт вычислительной техники CО РАН, Новосибирск)
BioUML – software platform for analysis of next generation sequencing data using collaborative and reproducible research - Денис Дмитриенко (Диаэм, Москва)
Новые инструменты для создания геномных библиотек - Дарья Смирнова (Хеликон, Москва)
Методы высокопроизводительного целевого обогащения участков ДНК для последующего NGS секвенирования
25 июля
Медицинская геномика
- Вадим Степанов (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
Высокопроизводительное генотипирование SNP: деканализация иммунного ответа при расселении современного человека - Дмитрий Барякин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
Короткие некодирующие РНК плазмы крови человека - Анна Савельева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
Состав рибонуклеиновых кислот внеклеточных везикул крови здорового человека. - Екатерина Трифонова (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
Выявление патофизиологических механизмов преэклампсии методом полногеномного анализа экспрессии - Мария Назаренко (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
Использование микрочиповых технологий для оценки уровня метилирования ДНК тканей сосудистой стенки и лейкоцитов периферической крови у больных атеросклерозом - Ольга Сайк (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
Анализ численной экспрессии генов по данным RNA-Seq для расширения «ассоциома» заболевания, реконструированного на основе информации из баз данных. - Florian Graedler (Illumina, Netherlands)
From Cancer to NIPT — NGS technology in clinical applications. - Павел Натальин (Life Technologies, Москва)
Высокопроизводительное секвенирование для фундаментальной науки и медицины