Научная программа

Скачать программу конференции

Устный доклад — 20 минут + 5 минут на вопросы (точное время см. в программе!).

Постеры могут быть представлены форматами А0, А1 или В1.

Расписание секций

18 июня — Открытие, Пленарные доклады

19 июня — Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция
NGS и анализ данных

20 июня — Метагеномика, Геномика прокариот и вирусов

21 июня — Геномика растений

22 июня — Палеогеномика
Геномика животных

23 июня — Медицинская геномика, Закрытие

Устные и постерные доклады

19 июня

Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция

Юлия Каргаполова (Центр молекулярной медицины (Кельн), Германия). A novel crosslinking and immunoprecipitation method reveals the function of CSTF2tau in alternative processing of snRNAs.
Дмитрий Грайфер (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Регионы хроматина, ассоциированные с ядрышком, – мишени рибосомного белка uS3, выявленные с помощью метода ChIP-seq
Дмитрий Андреев (НИИ Физико-Химической Биологии имени А.Н. Белозерского, МГУ). Рибосомный профайлинг — универсальный инструмент изучения регуляции экспрессии генов
Алексей Малыгин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН) Исследование функций рибосомных белков человека в регуляции экспрессии генов на уровне трансляции с использованием рибосомного профайлинга
Петр Сергиев (МГУ имени М.В. Ломоносова). Применение метода Flowseq для анализа эффективности трансляции библиотек бактериальных мРНК
Алексей Белогуров (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова). Разрушать, чтобы жить: особенности круговорота убиквитина в динамике
Анна Кудряева (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Изучение внутриклеточного метаболизма полиубиквитиновых цепей разного типа ветвления
Мирослав Нуриддинов (Институт цитологии и генетики СО РАН). Данные Hi-C Gallus gallus показывают взаимосвязь между свойствами генома и архитектурой хромосом
Илья Флямер (University of Edinburgh, Institute of Genetics and Molecular Medicine, MRC HGU). Масштабная реорганизация трёхмерной структуры хроматина при образовании зиготы, выявленная Hi-C на единичных ядрах
Евгений Журавлев (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Высокопроизводительное секвенирование для анализа функционирования m5C/Ψ-модифицированных аналогов малых ядерных и малых ядрышковых РНК в клетках человека

NGS и анализ данных

Марк Израельсон (Филиал Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Метод всестороннего анализа репертуаров Т-клеточных рецепторов
Николай Русских (Новые Программные Системы). Использование машинного обучения для платформы секвенирования нового поколения SeqLL
Кирилл Табанюхов (ИЦиГ СО РАН). Анализ экспрессии генов в животных моделях агрессивного поведения
Артур Дергилев (ИЦиГ СО РАН). 3D анализ хромосомных контактов с использование высокопроизводительного секвенирования
Юрий Букин (Лимнологический институт СО РАН). Процедура тримминга метагеномных данных, полученных путем высокопроизводительного секвенирования ампликонов
Ольга Киселева (Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича). «Мультиомикс» для исследования гетерогенности протеома
Федор Колпаков (Институт вычислительных технологий СО РАН). GTRD: база данных по сайтам связывания транскрипционных факторов, идентифицированных при помощи ChIP-seq экспериментов
Алла Лапидус (Санкт-Петербургский государственный университет). Task driven conversion of the SPAdes genome assembler into a family of SPAdes tools
Михаил Лебедин (Институт Биоорганической Химии им. Шемякина и Овчинникова РАН). Молекулярное баркодирование как средство безошибочного анализа репертуара антител
Анатолий Шлихт (ДВФУ). Геном-центрированная информационная система анализа и интерпретации омиксных данных человека

20 июня

Метагеномика, Геномика прокариот и вирусов

Юрий Галачьянц (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный анализ бактериальных сообществ байкальских губок выявил новые свойства сообществ, ассоциированных с Baikalospongia intermedia Северного Байкала
Евгений Андронов (ГНУ Всероссийский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии). Эволюционный и адаптационный потенциал почвенного микробиома
Туяна Банзаракцаева (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Таксономическое разнообразие протеобактерий в холодном источнике Буксыхен-сердечный (Бурятия)
Людмила Руднева (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Метабаркодирование для выявления диеты у даурской пищухи
Любовь Глухова (Томский государственный университет). Изучение молекулярных механизмов устойчивости гриба рода Penicillium к высоким концентрациям мышьяка и меди.
Ольга Дагурова (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Структура микробного сообщества прибрежной воды озера Байкал
Иван Дубовский (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Изменение состава микробиоты кишечника при формировании устойчивости насекомых к энтомопатогенным бактериям
Иван Егоров (Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства РАСХН). Изучение зависимостей между структурой микробных сообществ кишечника и активностью пищеварительных ферментов организма птицы.
Илья Никонов (ООО «БИОТРОФ»). Изучение микробиологических особенностей у кур мясных пород в эмбриональный и постэмбриональный периоды
Тамара Земская (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный анализ микробных сообществ для исследования цикла метана в озере Байкал
Николай Равин (ФИЦ Биотехнологии РАН). Метагеномный анализ экстремальных экосистем для характеристики некультивируемых линий микроорганизмов
Виталий Кадников (ФИЦ Биотехнология РАН). Молекулярный анализ микробного сообщества холодного сипа моря Лаптевых, обеспечивающего вовлечение метана в трофические цепи
Нина Кулакова (Лимнологический институт СО РАН). Исследование изменений в микробиоме Lubomirskia baicalensis при массовом заболевании байкальских губок
Лариса Ильина (ООО «БИОТРОФ»). Определение микробиоценозов кишечника кур породы «Хайсекс» методом T-RFLP в онтогенезе
Елена Лихошвай (Лимнологический институт СО РАН). Перспективы применения NGS для структурно-функциональной характеристики водных экосистем
Елена Минчева (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный подход к исследованию цветения нитчатых зеленых водорослей в Байкале: первые результаты.
Марсель Кабилов (ИХБФМ СО РАН). Проблемы и перспективы глубокого секвенирования ампликонов на примере 16S рРНК
Наталья Наумова (Институт почвоведения и агрохимии СО РАН). Bacterial 16S DNA diversity in soil under the Korean pine
Евгений Олехнович (ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА России). Изучение геномного контекста генов резистентности кишечных микробов при помощи метагеномных данных
Елизавета Старикова (ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА России). Анализ фаговых путей распространения генов антибиотикорезистентности с использованием метагеномных данных
Елена Эрдынеева (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Таксономическое разнообразие микробных сообществ двух соленых озер пустыни Бадаин Жаран (Внутренняя Монголия, Китай)
Аксенова Екатерина (ФГБУ «ФНИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России). Peculiarities of gram-negative and gram-positive bacteria
Татьяна Бутина (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный анализ вирусных сообществ в озере Байкал
Алексей Тотменин (ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора). Рекомбинантные варианты ВИЧ-1, циркулирующие в Новосибирской области
Алексей Тотменин (ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» Роспотребнадзора). Особенности генетических вариантов ВИЧ-1, выделенных на территории Томской области
Александр Ильиных (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Определение молекулярных детерминант патогенности вируса ядерного полиэдроза непарного шелкопряда Lymantria dispar
Анна Лемза (ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор»). Ретроспективный генетический анализ геномов штаммов вируса натуральной оспы, выделенных во время вспышки оспы 1959-1960 гг. в г. Москва
Александр Манолов (ФНКЦ Физико-химической медицины ФМБА России). Поиск генов бактерий вида Escherichia coli ассоциированных с болезнью Крона
Константин Мирошников (Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Оценка генетического разнообразия бактериальных патогенов картофеля
Мунтян Виктория (ФГБНУ ВНИИСХМ). Внутривидовой сравнительный анализ структуры хромосом клубеньковых бактерий люцерны Sinorhizobium spp.
Алла Саксаганская (ФГБНУ ВНИИСХМ). Нуклеотидный анализ генов вирулентности клубеньковых бактерий люцерны
Кирилл Мирошников (Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Характеристика геномов актуальных штаммов патогенов картофеля Pectobacterium и Dickeya
Анна Стенкова (Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г.Б. Елякова Дальневосточного отделения Российской академии наук ). Геномный анализ двух фукоидан-деградирующих альгоассоциированных флавобактерий Formosa algae KMM 3553 и KMM 8021
Мария Черкасова (ФГБНУ ВНИИСХМ). Анализ геномного острова Sme19T Sinorhizobium meliloti Rm1021: GC-состав и стабильность внутренней структуры

21 июня

Геномика растений

Добровольская Оксана (Институт цитологии и генетики СО РАН). Ранние этапы развития соцветия пшеницы: изучение генетического контроля и физиологии
Валерия Вавилова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Установление экзон-интронной структуры гена компактности колоса у ди-, тетра- и гексаплоидных пшениц
Анастасия Глаголева (Институт цитологии и генетики СО РАН). RNAseq-based decifering of molecular mechanisms underlying trait formation: non-alternative way in case of impeded metabolite identification
Артем Касьянов (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН). Возникновение ассиметрии регуляторных элементов на ранних стадиях эволюции геномов полиплоидов на примере генома аллотетраплоида Capsella bursa-pastoris
Алексей Кочетов (Институт цитологии и генетики СО РАН). Alternative ORFs within eukaryotic mRNAs
Виктор Левицкий (Институт цитологии и генетики СО РАН). Компьютерный анализ полногеномных данных указывает на роль типов хроматина в регуляции первичного ответа на этилен у Arabidopsis thaliana
Мария Логачева (Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова). Метабаркодинг растений с помощью NGS: обзор возможностей и практический опыт
Дарья Новикова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Functional annotation of auxin responsive cis-regulatory elements
Наталья Нуждина (Центральный сибирский ботанический сад СО РАН). Variation in the internal transcribed spacer (ITS) regions of nuclear ribosomal DNA in endemic Hedysarum species
Надежда Омельянчук (Институт цитологии и генетики). Ауксин координирует степень изменения уровня транскрипции генов внутри различных функциональных групп
Алексей Пенин (Department of Genetics, Lomonosov Moscow State University.). Ортологизация генов растений с использованием данных детализированных карт экспрессии.
Елена Салина (Институт цитологии и генетики). Сomparative analysis of 5b chromosome rearrangements during wheat evolution based on physical mapping and sequencing data
Екатерина Сергеева (Институт цитологии и генетики СО РАН). Детальная организация геномных районов хромосомы 5B мягкой пшеницы, маркированных локусом 5S рДНК
Вадим Шаров (Сибирский федеральный университет). Сборка и аннотирование генома лиственницы сибирской
Николай Шмаков (Институт цитологии и генетики). Исследование при помощи RNA-seq генов ячменя, контролирующих синтез хлорофилла
Анна Щенникова (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН). Гены факторов транскрипции YABBY в транскриптоме микогетеротрофа Monotropa hypopytis
Анна Щенникова (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН). Репродуктивное развитие паразитического растения Monotropa hypopytis: транскриптомный анализ MADS-box генов

22 июня

Геномика животных

Дарья Андреюшкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования
Кира Задесенец (Институт цитологии и генетики СО РАН). Изучение эволюции генома свободноживущего плоского червя Macrostomum lignano (Platyhelminthes, Turbellaria) с помощью высокопроизводительного секвенирования микродиссекционных ДНК-библиотек
Денис Ларкин (University of London). Реконструкция и анализ хромосомной организации геномов животных, отсеквенированных с помощью методов высокопроизводительного секвенирования
Алексей Макунин (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Высокопроизводительное секвенирование отдельных хромосом
Мария Побединцева (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальных геномов
Дмитрий Прокопов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Изучение кариотипа копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом
Алёна Степанова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Исследование транскриптома первичных эндотелиоцитов, культивируемых на поверхности микроволокнистых матриксов разного состава
Наталья Стефанова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Изменения траскриптома коры мозга при развитии признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS
Владимир Трифонов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus)

Палеогеномика

Анна Дружкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Секвенирование митохондриальных геномов древних и современных представителей семейства медвежьи (Ursidae) Западной Сибири
Надежда Воробьева (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Сборка полного митохондриального генома лошади Оводова (Equus ovodovi) из Денисовой пещеры
Мария Куслий (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Генотипирование древних лошадей археологического памятника Яломан-II
Ксения Попова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Изучение древней ДНК: митогеномы и В-хромосомы сибирской косули
Егор Прохорчук (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН). Сигналы отбора в геноме мамонтов
Татьяна Татаринова (ИППИ РАН). Сравнение сравнений: математические методы сравнительного анализа современных и древних последовательностей
Храмеева Екатерина Евгеньевна (Сколковский институт науки и технологий). Гены катаболизма липидов обогащены неандертальскими вариантами у современных европейцев

23 июня

Медицинская геномика

Артем Артемов (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН). Эпигенетические изменения при CRISPR/Cas9 инактивации гена VHL в клетках рака почки
Наталья Баулина (Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова). Полнотранскриптомный анализ экспрессии микроРНК в мононуклеарных клетках крови при рассеянном склерозе
Анна Бочарова (НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ). Репликативный анализ ассоциаций генетических маркеров болезни Альцгеймера, шизофрении и когнитивных функций с помощью мультиплексного генотипирования методом MALDI-TOF масс-спектрометрии.
Игорь Лебедев (НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ). Профилирование экспрессии генов в лимфоцитах индивидов с различной радиочувствительностью
Полина Гервас (НИИ онкологии, Томский НИМЦ). Полногеномное секвенирование нативной и фиксированной в формалине опухолевой ткани для идентификации в сравнительном аспекте молекулярно-генетических событий
Мария Голубенко (НИИ медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии медицинских наук). Оценка уровня гетероплазмии митохондриальной ДНК при атеросклерозе сонных артерий
Мария Гридина (Институт цитологии и генетики СО РАН). Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3
Евгений Денисов (НИИ онкологии, Томский НИМЦ). Поиск генетических нарушений, ассоциированных с инвазией рака молочной железы: пилотное исследование
Евгений Егоров (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Возрастные изменения в структуре Т-клеточных репертуаров
Дарья Жигалина (Томский государственный университет). Сравнение эффективности методов NGS и array CGH при детекции хромосомных аберраций у эмбрионов человека на стадии бластоцисты
Софья Касацкая (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова). Клональная селекция адаптивной субпопуляции Vδ1 гамма/дельта лимфоцитов, выявленная по анализу репертуаров Т-клеточных рецепторов наивных гамма/дельта Т-лимфоцитов и Т-клеток памяти
Иван Киселев (Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова). Полногеномные профили метилирования ДНК в CD4+ и CD14+ клетках больных рассеянным склерозом в зависимости от активности патологического процесса
Ольга Кривцова (Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова). Transcriptome-based analysis of allele-specific gene expression in hepatocellular carcinoma
Ольга Новикова (Сибирский федеральный биомедицинский исследовательский центр им.ак.Е.Н.Мешалкина»). Поиск генетических маркеров нестабильных атером
Никита Литовка (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Структура кольцевых РНК плазмы крови человека
Юлия Савиновская (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Влияние экзосом плазмы крови здорового человека на клетки человека in vitro
Николай Скрябин (НИИ медицинской генетики Томский НИМЦ). Таргетная оценка индекса метилирования с помощью бисульфитного секвенирования ампликонов
Айсен Соловьев (Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова). Доказательства эффекта основателя по мутации сайта сплайсинга c.-23+1G>A гена GJB2 в некоторых популяциях Евразии по данным полногеномного анализа
Евгений Журавлев (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Роль секретируемых некодирующих РНК в коммуникации между раковыми клетками