101. Редукция модели CD95-индуцируемого апоптоза

В работе рассмотрена математическая модель CD95-индуцируемой регуляции программируемой смерти клетки (апоптоза), разработанная M. Bentele и соавт. [1]. На основании методов редукции [2] при помощи программного комплекса BioUML (http://www.biouml.org) выявлены быстрые и медленные реакции модели, исследованы короткоживущие промежуточные  комплексы, произведено упрощение реакций на основе кинетики Михаелиса-Ментен. Помимо этого, исследованы процессы, биохимические механизмы которых до конца не изучены. В модели таким процессам соответствуют “черные ящики” с заданными математическими функциями. В результате упрощения модели количество ее элементов уменьшилось в два раза, а число реакций сократилось с 78 до 40. При этом результаты симуляции модели для оставшихся элементов практически не изменились. Примененный подход позволяет оптимизировать объемные модели и упростить вычисления, что является важным моментом при создании на их основе более сложных комплексных моделей биологических систем.