110. О метрических свойствах эволюционных расстояниях

Одним из способов изучения изменчивости биологических объектов является геометризация задачи: представление объектов точками в многомерном пространстве таким образом, чтобы расстояния между точками как можно лучше соответствовали различиям между объектами. Если различия между объектами являются евклидовыми расстояниями, то эта задача (с точностью до переноса, поворота и отражения) решается методами метрического шкалирования. В некоторых случаях к различиям можно применить монотонное преобразование, переводящее их в евклидовы расстояния. В остальных случаях приходится использовать другие методы, в частности, алгоритмы неметрического шкалирования.

Рассмотрены метрические свойства некоторых эволюционных дистанций для нуклеотидных последовательностей. Показано, что расстояния Джукса-Кантора и Кимуры не являются метриками.