Создан простой метод анализа режимов эволюции белков, основанный на Марковском моделировании. Используя созданный метод, мы провели анализ режимов эволюции более 2450 ортологичных групп белков (ОГБ) позвоночных и беспозвоночных, полученных из базы данных MetaPhOrs [1]. В результате анализа было показано, что внутренние ветви, содержащие >20% OГБ, имеющих нетипичные, статистически редкие (p<0.01), типы аминокислотных замен, соответствуют основным ароморфозам позвоночных: 1) периодам полногеномных дупликаций при формировании позвоночных и рыб, 2) выходу на сушу, 3) формированию амниот, 4) дивергенции млекопитающих, а также группы плацентарных. Показано, что формирование Insecta и Diptera, сопровождаемое увеличением числа ОГБ с нетипичными аминокислотными заменами, может быть связано с формированием тесного экологического сообщества насекомых и покрытосеменных растений [2]. В настоящей работе также проведен сравнительный анализ функций ОГБ с нетипичными аминокислотными заменами на каждой внутренней ветви дерева позвоночных и беспозвоночных, что позволило связать режимы молекулярной эволюции ОГБ с морфологическими преобразованиями в палеонтологической летописи таксонов Bilateria.
| Файл тезисов: | Lyapunov-rus&eng.pdf |