М.Ю. Казанцев; П.Ю. Меркулов; К.Н. Тюрин; Я.Н. Демурин; И.В. Киров
Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет; ФГБНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии»; Всероссийский научно-исследовательский институт масличных культур им. В. С. Пустовойта
irelanddets@gmail.com
Исследование посвящено мобильным элементам в геноме подсолнечника, который на ~75% состоит из ретротранспозонов. Большинство из них в нормальных условиях неактивны, но активные копии способны перемещаться, вызывая структурные перестройки в геноме и влияя на эволюцию и адаптацию растений. Для изучения активности транспозонов мы индуцировали их мобильность в геноме подсолнечника и проанализировали внехромосомные кольцевые ДНК (eccDNA) с помощью секвенирования. Полученные данные, а также публично доступные результаты секвенирования 12 сортов подсолнечника, были использованы для: филогенетического анализа, предсказания структуры белков и изучения хромосомного распределения ретротранспозонов в геноме Helianthus annuus L.
2-prav-Plantgen-25-1