Организаторы:
Institute for Microbial Technology (CSIR), Chandigarh, India
Institute of Genomics and Integrative Biology (CSIR), New Delhi, India
Российские координаторы:
Prof. Nikolay Kolchanov, Academician, IC&G SB RAS, Novosibirsk, Russia
Dr. Dmitry Afonnikov, Head, Evolutionary Bioinformatics, IC&G SB RAS, Novosibirsk, Russia
Индийские координаторы:
Dr. G.P.S. Raghava, Head Bioinformatics Centre, Institute of Microbial Technology(CSIR), Chandigarh, India
Dr. S. Ramachandran, Institute of Genomics and Integrative Biology, New Delhi, India
Тема семинара:
Инфекционные болезни представляют одну из наиболее главных опасностей в области здравоохранения в мировом масштабе. В последние годы как в фундаментальной так и в прикладной биологии и медицине интенсивно появляются новые данные о структуре геномов патогенных микроорганизмов, их метаболических и функциональных особенностях, деталях взаимодействий их генетических макромолекул (ДНК,РНК и белков), метаболитов и соединений лекарственного типа. Интенсивный процесс накопления этих знаний характерен, в том числе и для таких стран как Индия и Россия. Интеграция этих знаний на системном уровне, их тщательный анализ и дополнительная обработка с использованием современных математических и компьютерных методов позволит разработать новые подходы для борьбы с патогенными микроорганизмами.
Новый интегрированный подход будет эффективен, в том числе и для предсказания новых лекарственных соединений для борьбы с патогенами. Для того чтобы более тесно интегрировать усилия индийских и российских ученых в разработке новых системных подходов к борьбе с туберкулезом и другими опасными инфекционными заболеваниями, решено организовать совместный Индо-Российский семинар “Предсказательная биология с использованием системного и интегрированного анализа и методов ” в 2010 г.
Целью семинара является обмен опытом и интеграция усилий ведущих ученых из России и Индии в области системной биологии, биоинформатики, исследований белка и компьютерной геномики. Участники семинара представят доклады по работам в рамках системной биологии и геномной информатики. Основное прикладное значение данных работ будет заключаться в теоретическом и компьютерном анализе патогенных микроорганизмов, систем взаимодействия патоген-человек, разработке новых методов борьбы с туберкулезом и другими инфекционными заболеваниями.
Этот семинар будет являться продолжением предыдущей встречи индийских и российских биоинформатиков «Cистемная биология и геномная информатика M. tuberculosis и других инфекционных заболеваний», проведенной в октябре 2008 г. в Новосибирске.
Цель проведения семинара:
Инфекционные болезни являются одними из основных причин гибели людей в таких странах как Россия и Индия. В последние годы заболевание наиболее опасными заболеваниями, такими как туберкулез, встречается все чаще, в силу способности микроорганизмов к адаптации и изменениям. Более того, новые патогенные организмы появляются в результате динамического взаимодействия между патогенном, хозяином и окружающей средой. Поэтому традиционные подходы к лечению новых инфекций и вновь возникающих заболеваний недостаточно эффективны. Использование комбинированных и интегрированных подходов представляется перспективным при лечении опасных заболеваний. Методы системной биологии предоставляют в этой связи новые возможности. Новые экспериментальные методы высокопроизводительного анализа (микрочипы, масс-спектрометрия белков, методы ChIP и высокопроизводительного секвенирования) предоставляют огромное количество данных по взаимодействиям между патогенном и хозяином, патогенностью заболевания, иммунным ответом и т.п. Однако получаемые данные зачастую фрагментированы. Чтобы создать целостную картину сложной сети взаимодействий, вовлеченных в инфекционное заболевание, необходимо объединить современные знания и заполнить существующие пробелы. Это может быть сделано на основе системной биологии. Новая парадигма интеграции современных экспериментальных, теоретических и компьютерных методов анализа от молекул до уровней клетки и организма представляется перспективной. Она завоевывает все большее признание в мире, включая Россию и индию. Тесное сотрудничество ученых в этом направлении может обеспечить прорыв для решения сложнейших задач.
Основные темы семинара
Новые интегрированные методы создания лекарств
Систеиный анализ взаимодействия патоген-хозяин
Аннотация для предсказания метаболитов
Неструктурные районы белка и их роль в белок-белковых взаимодействиях
Анализ поверхностей белок-белковых взаимодействий на микроуровне
Вычислительные платформы для интегративного анализа
Методы искусственного интеллекта для предсказаний в биологии
Анализ геномных последовательностей как основа системной биологии.
Список Российских участников
Prof. Nikolai Kochanov, Director, Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk
Dr. Dmitry Afonnikov, Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk
Prof. Sergey Deyev, Shemyakin & Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Moscow
Prof. Alexander Efimov, Institute of Protein Research, Pushchino
Prof. Roman Efremov, Shemyakin & Ovchinnikov Institute of Bioorganic Chemistry, Moscow
Dr. Vladimir Ivanisenko, Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk
Prof. Alex Ivanov, Institute of Biomedical Chemistry RAMS, Moscow
Dr. Alex Kochetov, Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk
Prof. Vsevolod Makeev, Institute of genetics and selection of industrial microorganisms, GosNIIgenetika, Moscow
Dr. Yurii Matushkin, Institute of Cytology and Genetics, Novosibirsk
Список Индийских участников
Samir K. Brahmachari, Council of Scientific and Industrial Research, New Delhi India.
Prof. Alok Bhattacharya, Jawaharlal Nehru University, New Delhi, India
Dr. Nagasuma Chandra, Indian Institute of Science, Bengluru, India
Dr. Andrew M. Lynn, Jawaharalal Nehru University, New Delhi, India
Dr. Shekhar C. Mande, Centre for DNA Fingerprinting and Diagnostics, Hyderabad, India
Dr. Debasisa Mohanty, National Institute of Immunology, New Delhi, India.
Dr. G.P.S. Raghava, Institute of Microbial technology, CSIR, Chandigarh, India
Dr. S. Ramachandran, Institute of Genomics and Integrative Biology, Delhi, India
Dr. R. Ravishankar, Central Drug Research Institute, Lucknow, India
Dr. RamaSubbu Sankar, Indian Institute of Technology, Kanpur, India
Dr. Vinod Scaria, Institute of Genomics and Integrative Biology, Delhi, India
Специально приглашенные доклады
Dr. Anshu Bhardwaj, Institute of Genomics and Integrative Biology, Delhi, India
Dr. Amit Nargotra, Indian Institute of Integrative Medicine, Jammu, India
Dr. Ravishankar, Institute of Himalayan Biotechnology, Palampur, India
Shri Zakir Thomas, Council of Scientific and Industrial Research, Delhi, India
Financial Support
 |
Russian Foundation for Basic Research |
 |
Department of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, India |