В программу международного симпозиума “Биоразнообразие: геномика и эволюция” входит работа двух научных секций и проведение открытого рабочего совещания по проекту мега-гранта. Руководить секциями будут два со-сопредседателя профессор: Л.Л. Мороз (Флорида, США) и профессор И.В. Довгаль (Севастополь, Россия). Пленарные и секционные устные доклады будут представлены в первый и второй день работы симпозиума, сессия постерных докладов планируется в первый, а рабочее совещание – во второй день мероприятия.
Тематика симпозиума объединит несколько научных направлений по двум основным разделам.
Секция
«Новейшие технологии массового параллельного секвенирования отдельных клеток»
(Novel technology of massive parallel single-cell sequencing).
Председатели секции:
профессор Л.Л. Мороз (Университет Флориды, США),
профессор Д. Эренд/D. Arendt (EMBL, Хайдельберг, Германия).
На секции будут обсуждаться новейшие технологии молекулярно-генетического анализа единичных клеток, включая технологии массового параллельного секвенирования геномов, транскриптомов, эпигенома отдельных клеток, вопросы обработки и анализа получаемых в результате огромных массивов данных, вычислительные методы для кластеризации и визуализации данных в геномике единичных клеток, а также методологические аспекты реализации этих данных: составление атласов клеточных типов по основным таксонам эволюционного древа, компьютерное моделирование пространственной структуры клетки с помощью секвенирования. Особое внимание будет уделено возможностям использования новейших технологий секвенирования и анализа единичных клеток для решения фундаментальных вопросов в области классификация и эволюция клеточных типов.
Секция
«Глобальное биологическое разнообразие» (Global biodiversity)
Председатель секции:
профессор И.В. Довгаль (Россия), Г. Паули/ G. Pauley (Музей естественной истории, Флорида, США).
Предметом обсуждения секции будут вопросы макроэволюции организмов по всем таксонам эволюционного древа, включая человека, современные проблемы филогеномики, фундаментальные вопросы эволюции, а также геномные основы видообразования, молекулярные механизмы адаптации организмов к условиям существования, в том числе экстремальным. Отдельно будут обсуждаться междисциплинарные вопросы эволюции нервных систем, а также эволюционные аспекты биологии развития животных.
Секция
Открытое рабочее совещание по направлению «Реконструкция генеалогии клеточных систем на основе биоразнообразия Мирового океана».
Председатели секции:
профессор Л.Л. Мороз (Университет Флориды, США),
академик РАН Н.А. Колчанов (Новосибирск, Россия).
Будут представлены текущие результаты исследования, выполняемого под руководством ведущего ученого профессора Л.Л. Мороза, в рамках реализации Постановления Правительства РФ Р220 от 9 апреля 2010 г. (Договор № 14.W03.31.0015 от 28 февраля 2017 года). На совещании будут обсуждены фундаментальные научные вопросы, связанные с реализацией заявленного направления, сформированы предложения по формированию и механизмам реализации комплексной международной программы исследования глобального биологического разнообразия на основе новейших single-cell технологий для биологии, медицины, развития компьютерной инфраструктуры и здоровья планеты.
| Тип доклада | ФИО докладчика | Название доклада |
| 1. Пленарный | D. Arendt. EMBL, Heidelberg, Germany | Cell types as evolutionary units. |
| 2. Пленарный | L. L. Moroz. University of Florida, Florida, USA | Multiple Origins and Evolution of Neurons and Brains through the lens of single cell genomics. |
| 3. Пленарный | Jacob Mosser. EMBL, Heidelberg, Germany | Computational and experimental analysis of cell type evolution, |
| 4. Пленарный | G. Pauley. Florida Museum of Natural History, Florida, USA | Global Oceanic Mega-Biodiversity and Adaptations. |
| 5. Пленарный | K. Worsaae. University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark | Cellular Organization and Evolution of Spiralia: Insight from miofauna. |
| 6. Пленарный | L. Gentzbittel, C. Ben, M. Mazurier, M.G. Shin, T. Lorenz, M. Rickauer, P. Marjoram, S.V. Nuzhdin, T.V. Tatarinova. Institut National Polytechnique de Toulouse, Toulouse, France | Genome admixture components accurately predict quantitative functional traits in plants. |
| 7. Устный | D.O. Omelchenko, A.A. Krinitsina, M.D. Logacheva, M.S. Belenikin, E.A. Konorov, S.V. Kuptsov, A.P. Seregin, A.S. Speranskaya. ScolTech, Moscow, Russia | Comparison of evolutionary rates of the regions and nucleotide substitutions in the Allium plastomes. |
| 8. Устный | A.G. Mikhaylova, A. A. Mikhaylova, K. Ushakova, E. Tretyakov, A. Yurchenko, D. Knorre, I. Mazunin, A. Reymond, K. Gunbin, K. Popadin. IKBFU, Kaliningrad, Russia | Transition transversion ratio in mtDNA is higher in long- versus short-lived mammalians: effects of ROS and replication? |
| 9. Устный | P. Shanmughavel and Praveen Kumar K. Government institution, Coimbatore, India | Development of National Information System (NIS) for Sustainable Management of Biodiversity. |
| 10. Устный | A. Rozanov, A. Korzhuk, S. Peltek. ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Microbial diversity in the hot spring Faust Lake, Kunashir Is-land. |
| 11. Устный | Mikheyev, E. Batyeva, V. Klyuchniov, Yu. Orlov, N. Moshkov, I. Dmitrievsky, T. Lorentz and T. Tatarinova. IOGEN, Moscow, Russia | Genetic footprints of Medieval nomads on the crossroads of civilizations in Southern Russian. |
| 12. Устный | N. Adonyeva, E. Burdina, N. Gruntenko, I. Rauschenbach. ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Effect of Stress-related Hormones on Host Drosophila Fitness Depends on Endosymbiont Wolbachia Genotype. |
| 13. Устный | Yu. Ilinsky, E. Lunev, S. Toshchakov, J. Podgwaite, V. Martemyanov. ISEA SB RAS, Novosibirsk, Russia | Comparative genome analysis of related Lymantria dispar nucleopolyhedrovirus isolates differing in virulence. |
| 14. Устный | S. Mikhailova, A. Barkhash, I. Kozlova, I. Borischuk, N.Yudin, O. Zaitseva , L. Pozdnyakova, M. Voevoda. ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Haplotype Analysis of the HFE Gene Among Patients with Different Forms of Tick-borne Encephalitis. |
| 15. Устный | N. Bolsheva, I. Kirov, N. Melnikova, A. Dmitriev, G. Krasnov, А. Amosova, T. Samatadze, O. Yurkevich, S. Zoshchuk, T. Rozhmina, A. Kudryavtseva, O. Muravenko. IMB RAS, Moscow, Russia | Repeated DNA Sequences in Genomes of Species of the Genus Linum. |
| 16. Устный | N.Е. Gruntenko, N.V. Adonyeva, Y.Y. Ilinsky, E.V. Burdina, O.V. Andreenkova, R.A. Bykov, I.Yu. Rauschenbach. ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Host Drosophila fitness and hormonal status depends on the genotype of Wolbachia symbiont. |
| 17. Устный | O. Dolgova, I. Maceda, O. Lao. CNAG-CRG, Barcelona, Spain | Evolutionary History of Native Americans drown by Deep Learning Approach. |
| 18. Устный | S.V. Shekhovtsov, N.I. Ershov, G.V. V.Vasiliev, S.E. Peltek, ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Inferring phylogeny among cryptic lineages of Eisenia nordenskioldi nordenskioldi (Lumbricidae) based on transcriptomic data. |
| 19. Устный | E.A. Konorov, V.O. Burskaya, I.V. Artyushin, V.A. Scobeyeva, G.N. Markevich, N . Osman, S.V. Nuzhdin, M. V. Lomonosov MSU, Moscow, Russia | Comparative analysis of transcriptome from different sympatric morphs of Dolly Varden Salvelinus malma from the Kronotskoe Lake. |
| 20. Устный | P. Vorozheykin, I. Titov. ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Mirtrons as a possible inherent source of silencing variability. |
| 21. Устный | A. E. Dresvyannikova, A.F. Muterko, A. A. Krasnikov, N.P. Goncharov, N. Watanabe, O. B. Dobrovolskaya. ICiG SBRAS, Novosibirsk, Russia | Identification and study on Lgt – a new cereal gene for liguleless leaf phenotype. |
| 22. Устный | E. S. Gusareva, E. Acerbi, K. J.X. Lau, A. Wong, et al., SCELSE, Nanyang Technological University, Singapore. | Diel cycle of the tropical air microbiome |
| 23. Устный | O. Krivenko. IMBR RAS, Sevastopol, Russia | Biodiversity of the Black Sea. |
| 24. Устный | I. Mitrofanova. Nikita Botsad, Yalta, Russia | Biodiversity of land plants and its preservation. |
| 25. Устный | I. Dovgal. IMBR RAS, Sevastopol, Russia | Biodiversity and Evolution of Unicellular and colonial Eukaryotes. |
| 26. Устный | Y. Novozhilov, Schepin O.N.. BIN RAS. St.-Petersburg, Russia | «Скрытое разнообразие грибов и грибообразных протистов: проблемы и перспективы». |
| 27. Устный | V. Starunov. StPSU, St.-Petersburg, Russia | Genomic and organization of “simple phyla”: Insights from Orthonectid to Bryozoa. |
| 28. Устный | Y. Orlov, ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Computer methods for 3D genome organization studies by sequencing. |
| 29. Устный | D. Afonnikov, I. Sidorenko ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Histone modifications and chromosome structure models by Hi-C data. |
| 30. Устный | Nesterenko, V. Starunov, S. Shchenkov*, A. Dobrovolskij, K. Khalturin, StPSU, St.-Petersburg, Russia | Complex life cycle: a set of phenotypes on the single genome |
| 31. Устный | E. Vodyasova, E. Chelebieva. IMBR RAS, Sevastopol, Russia | Genomic biology of Trichoplax. |
| 32. Устный | D. Romanova. IMBR RAS, Sevastopol, Russia | Biodiversity and genomics of diatoms. |
| 33. Устный | O. Kuleshova. IMBR RAS, Sevastopol, Russia | Single-cell bioinformatics: practical implementations. |
| 34. Стендовый | P. Kezimana, A. Dmitriev, T. Rozhmina, R. Novakovskiy, E. Romanova, A. Kudryavtseva, N. Melnikova, IMB RAS, Moscoq, Russia | Polymorphism in Genes Related to Fatty Acid Composition in Linum usitatissimum. |
| 35. Стендовый | A. Tikhomirova, M. Yudina, G. Yurlova, R. Bykov, A. Bugrov, Yu. Ilinsky. NSU, Pavlodar, Kazachstan | Endosymbiotic Bacteria Wolbachia in Siberian Populations of Acrididae grasshopper (Orthoptera). |
| 36. Стендовый | T. Bikchurina, T. Vasil’eva, M. Pavlenko, I. Sheremet’eva, I. Kartavtseva. NSU, Novosibirsk, Russia | Synapsis and recombination in intra- and interspecies hybrids between two voles species Microtus (Alexandromys) evoronensis и M. maximowizcii. |
| 37. Стендовый | A.B. Shcherban, A.I. Stasyuk, E.A. Salina. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Polymorphism in the Promoter Region of the Squalene Synthase Gene in. |
| 38. Стендовый | Daniil G. Naumoff. INMI, Moscow, Russia | Massive Inter-Phylum Lateral Gene Transfer from Planctomycetes: the Case of TIGR02604 Family of the Putative Glycoside Hydrolases. |
| 39. Стендовый | I. Sukhikh, K. Ustyantsev, V. Vavilova, A. Blinov. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Revised molecular phylogeny of Acrididae family. |
| 40. Стендовый | A.V. Igoshin, K.V. Gunbin, N.S. Yudin, M.I. Voevoda. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Searching for signatures of cold adaptation in human TRP genes. |
| 41. Стендовый | M. Yudina, V. Dubatolov, R. Bykov, I. Mazunin, Yu. Ilinsky. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Genetic Diversity and Phylogeny of Wolbachia in Lepidopteran Hosts. |
| 42. Стендовый | M.Krohaleva, D.Fedorov, G.Ekimova. UrSU, Ekaterinburg, Russia | Phylogenetic Analysis of Genes Encoding the Enzymes of Plant Amino Acids Catabolism in Representatives of the Genus Methylobacterium. |
| 43. Стендовый | A. Kuzminkova, K.Yu. Popadin, K.V. Gunbin, IKBFU, Kaliningrad, Russia | Finding shifts in the evolution of mitochondrial metabolism. |
| 44. Стендовый | L. Malinovskaya, N. Torgunakov, A. Torgasheva. НГУ, Новосибирск, Россия | Recombination landscapes in eight avian species. |
| 45. Стендовый | Е. П. Артёменко. UrSU, Ekaterinburg, Russia | Genetic Diversity of Taraxacum Officicnale Wigg. Local Populations in Nizhniy Tagil Habitats Different in The Level Of Technogenic Load. |
| 46. Стендовый | Е. П. Артёменко. UrSU, Ekaterinburg, Russia | Genetic Diversity of Plantago major L. Local Populations in the Habitatsof NizhniyTagil Differed by the Level of Technogenic Load. |
| 47. Стендовый | Е. П. Артёменко. UrSU, Ekaterinburg, Russia | Биологическое разнообразие локальных популяций. |
| 48. Стендовый | A. Dmitriev, T. Rozhmina, G. Krasnov, A. Snezhkina, R. Novakovskiy, P. Kezimana, N. Bolsheva, O. Muravenko, A. Kudryavtseva, N. Melnikova. IMB, Moscow, Russia | Genetic Diversity of Cultivated Flax Based on CesA Genes. |
| 49. Стендовый | O. Dolgova, R. Mulet, L. Llobet, S. Casillas, T. Vavouri. CNAG-CRG, Barcelona, Spain | Evolutionary Patterns of piRNA-generating Clusters in Human Genome. |
| 50. Стендовый | O.I. Tsygankova, E.A. Koteneva, А.V. Kalinin. Stavropol Antiplague Institute, Stavropol, Russia | Specific anthrax bacteriophages as a factor for selection of subcultures with different phenotypic and genetic characteristics out of populations of Bacillus anthracis strains. |
| 51. Стендовый | L.S. Samarina, V.I. Malyarovskaya, R.S. Rakhmangulov, Y.L. Orlov , O.B. Dobrovolskaya, RRI FSC, Sochi, Russia | Challenges of in vitro conservation of Сitrus genetic resources. |
| 52. Стендовый | I.N. Shekhovtsova, S.V. Shekhovtsov, S.E. Peltek, ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | An intron of the hsp90 gene as a new promising phylogenetic marker for the genus Carex L. |
| 53. Стендовый | A. Rozanov, A. Shipova, A. Bryanskaya, E. Lazareva, O. Taran, S. Peltek. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Metagenomic Analysis of Metabolically Active Microbial communities of Salenoye Lake #48 in the Novosibirsk Region. |
| 54. Стендовый | V.A. Shamanskiy, K.Yu. Popadin, K.V. Gunbin, IKBFU, Kaliningrad, Russia | The software and database for Vertebrate imperfect mtDNA repeats annotation. |
| 55. Стендовый | V.N. Timonina, D.A. Knorre, K.Yu. Popadin, K.V. Gunbin, IKBFU, Kaliningrad, Russia | The reasons for mtDNA structural instability: evolutionary physico-chemical retrospective. |
| 56. Стендовый | V. Vavilova, I. Konopatskaia, A. Blinov. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Genomic characterization of DEP1 gene in the Triticinae species with compact, compactoid and normal spike shape. |
| 57. Стендовый | V. Suslov. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Ontology of homologous series. |
| 58. Стендовый | V. Suslov, M. Ponomarenko, D. Rasskazov. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Homologous series and parallel evolution problem. |
| 59. Стендовый | M. Zytsar, M. Bady-Khoo, E. Maslova, V. Danilchenko, N. Barashkov, I. Morozov, A. Bondar, O. Posukh. ICiG SB RAS, Novosibirsk, Russia | Allelic Diversity of the GJB2 Gene in Deaf Patients and Ethnically Matched Populations from South Siberia. |
