Устный доклад — 20 минут + 5 минут на вопросы. Формат презентации 16:9.
Постерные сессии пройдут 20 и 22 июня. Постеры желательно представлять в форматах B1, А0 или А1. Любой из этих форматов можно оперативно распечатать в Paparazzi (Морской проспект 27).
Расписание секций
19 июня — Открытие конференции (17:00), пленарная лекция
Пётр Сергиев, чл.-корр. РАН (НИИ Физико-химической биологии МГУ).
Toe-Seq: анализ сиквенс-специфичности антибиотиков, ингибирующих трансляцию
20 июня — Геномика растений
Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция
21 июня — NGS методы и анализ данных
Геномика прокариот и вирусов
22 июня — Метагеномика
23 июня — Геномика животных
Медицинская геномика
24 июня — Медицинская геномика, закрытие (12:30)
Устные и постерные доклады
Геномика растений
- Дмитрий Афонников (Институт цитологии и генетики СО РАН). Reconstruction and analysis of pangenome of Siberian cultivars of potato Solanum tuberosum
- Евгения Бондар (Сибирский федеральный университет). Annotation of Siberian larch reference genome, the only seasonal senescence genus in Pinaceae
- Екатерина Дворянинова (Институт молекулярной биологии РАН). На пути к созданию пангенома льна
- Мария Логачева (Сколковский институт науки и технологий). Genome and transcriptome of an invasive plant species Heracleum sosnowskyi
- Алексей Пенин (Институт проблем передачи информации РАН). Опыт сборки геномов полиплоидных организмов на примере тетраплоида Capsella bursa-pastoris.
- Любовь Повхова (Институт молекулярной биологии РАН). Методы идентификации ключевых полиморфизмов генов FAD3A и FAD3B, ответственных за содержание линолевой и линоленовой жирных кислот в льняном масле
Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция
- Алексей Белогуров (Институт биоорганической химии РАН). Дискретность модуляции амплитуды сигнала протеасомной деградации
- Сергей Дмитриев (НИИ Физико-химической биологии МГУ). Белок-кодирующий потенциал повторяющихся элементов генома человека
- Мария Зверева (Химический факультет МГУ). Селекция нового аптамера к SARS-CoV-2 с помощью нанопорного секвенирования
- Елизавета Золотенкова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). The role of hydroxylation of the human ribosomal protein uL15 in the regulation of gene expression at the level of translation
- Алена Колобова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Knockdown of ribosomal protein el38 in mammalian cells leads to a substantial reorganization of genomic transcription and changes in the translational efficiency of specific genes
- Евгения Колосова (ГНЦ ВБ «Вектор»). Анализ результатов фагового дисплея на платформе Ion
- Александра Кузнецова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Сиквенс-специфичность безматричного синтеза нуклеотидтрансферазой человека
- Алексей Малыгин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Exploiting next generation sequencing in studies of gene expression disorders caused by a cellular deficiency of ribosomal proteins or mutations in them
- Елизавета Шатунова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Селекция аптамеров к белку Dkk-1 из ДНК-библиотеки с неравномерной случайной областью
- Tian Yueming (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Transcriptome changes caused by mutations in the RPS20 gene associated with a predisposition to hereditary non-polyposis colorectal carcinoma
NGS и анализ данных
- Нариман Баттулин (Институт цитологии и генетики СО РАН). ДНК-баркодированные сенсоры для исследования механизмов интеграции трансгенов в геном
- Антон Большаков (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Получение и использование транспозазы Tn5 для приготовления NGS библиотек.
- Андрей Кечин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Опыт применения технологии секвенирования Oxford Nanopore для выявления герминальных мутаций
- Анастасия Матвеева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Редактирование интронов с помощью CRISPR/Cas9 и последующий транскриптомный анализ как инструмент для функциональных исследований
- Анна Молявко (Институт вычислительного моделирования СО РАН). Новый метод сравнения генетических последовательностей, не использующий идею выравнивания
- Михаил Помазной (ООО «Новые Программные Системы»). Программное обеспечение для интерпретации генетических вариантов NGS Wizard
- Михаил Садовский (Институт вычислительного моделирования СО РАН). Таксономическое положение бактерий коррелирует с триплетным составом их генов 16S РНК
- Михаил Фофанов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Application of hi-c genome scaffolding to improve cytogenetic chromosome maps and detect genomic rearrangements
- Анатолий Шлихт (Дальневосточный Федеральный Университет). Единая геном-центрированная высокоструктурированная модель для анализа и интерпретации омиксных данных
- Кристина Яковлева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Разработка химических подходов к снижению уровня ошибочности в составе синтетических олигонуклеотидов для сборки генных конструкций
Геномика прокариот и вирусов
- Маргарита Баранова (Институт биоорганической химии РАН). Использование технологий глубокого функционального профилирования микробиома для исследования биоразнообразия пробиотических штаммов Bacillus
- Петр Евсеев (Институт биоорганической химии РАН). Профаговые области в геномах Curtobacterium spp. и Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens: геномика и белки, разрушающие клеточную стенку
- Валерий Кадуцкий (Институт леса СО РАН). Новые штаммы прокариот, обладающие метанотрофной активностью
- Илья Кандинов (Институт молекулярной биологии РАН ). Полногеномный анализ Neisseria gonorrhoeae и устойчивость к антимикробным препаратам
- Александра Козлова (ВНИИ Сельскохозяйственной Микробиологии). Джамбо-фаг Sinorhizobium meliloti
- Татьяна Крыцына (Новосибирский государственный аграрный университет). Изучение стратегий выживания бактерий Bacillus Thuringiensis в организме чувствительного и резистентного хозяина
- Эмма Пилигримова (Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН). Плазмидные профаги Bacillus cereus могут быть источником богатого разнообразия фагов
- София Пипия (Институт биоорганической химии РАН). Гетерологическая продукция антимикробных пептидов в метилотрофных дрожжах Pichia pastoris
- Мария Хренова (Химический факультет МГУ). Нанопорное секвенирование и анализ данных бактериальных геномов
- Андрей Шадрин (Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН). Определение механизма упаковки ДНК и концов хромосомы бактериофагов с использованием методов NGS И RAGE
- Ольга Шишкина (Институт цитологии и генетики СО РАН). Сравнительный геномный анализ штаммов Wolbachia pipientis, различающихся по влиянию на стрессоустойчивость Drosophila melanogaster
Метагеномика
- Андрей Брюханов (Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова). Филогенетический состав сообществ сульфатредуцирующих микроорганизмов в донных отложениях Баренцева моря на основе анализа данных высокопроизводительного секвенирования фрагментов гена 16S рРНК
- Ольга Воронина (НИЦ эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи Минздрава). The impact of CFTR modulator therapy on the restoration of the normal lung microbiome
- Григорий Гладков (ВНИИ Сельскохозяйственной Микробиологии). Использование различных подходов высокопроизводительного секвенирования при анализе минимальных целлюлозолитических микробных сообществ
- Анна Децура (Институт леса СО РАН). Метагеномный анализ как инструмент оценки активности и структуры сообществ метаногенных архей в донных отложениях реки Енисей
- Александра Заушинцена (Кемеровский государственный университет). Состав и структура архей в биопрепарате «ТОР-органик»
- Марсель Кабилов (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). По ту сторону метабаркодинга: проблемы и перспективы
- Екатерина Каманова (ГНЦ ВБ «Вектор»). Метагеномный анализ геномных и транскриптомных данных насекомых семейства Simuliidae и Ceratopogonidae
- Вадим Крюков (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Взаимосвязь структуры микробиома почв картофельных полей с уровнем фунгистазиса
- Елена Минчева (Лимнологический институт СО РАН (Иркутск)). Метабаркодинг сообществ низших грибов, ассоциированных с водорослями оз. Байкал
- Алексей Мошкин (ГНЦ ВБ «Вектор»). Исследование биоаэрозолей на территории РФ
- Наталья Наумова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Микробиом аэрозолей приземного и нижнего слоев тропосферы
- Наталья Наумова (Институт почвоведения и агрохимии СО РАН). Бактериобиом и микобиом в корнях растений томата при выращивании в открытом грунте
- Мария Пахарукова (ИЦиГ СО РАН). Трехсторонние отношения эпидемиологически значимых трематод: описторхиды, микробиота и клетки хозяина
- Екатерина Писарева (Дальневосточный Федеральный Университет). Метагеномный анализ бактериальных сообществ поверхностных вод из прибрежных акваторий Приморского края
- Ольга Поленогова (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Метагеномика бактериальных сообществ колорадского жука: влияние бактерий на развитие патогенезов и токсикозов
- Юлия Серазетдинова (Кемеровский государственный университет). Метагеномный анализ техногенно нарушенных почв
- Мария Старчевская (ГНЦ ВБ «Вектор»). Метагеномный анализ вирома Leptinotarsa decemlineata
- Степан Тощаков (НИЦ «Курчатовский институт»). Метагеномный анализ микробных сообществ горячих источников Кармадонского ущелья, Северная Осетия.
Геномика животных
- Татьяна Бикчурина (Новосибирский государственный университет). Поиск дифференциально экспрессирующихся генов, ассоциированных с гибридной стерильностью у полевок Microtus rossiaemeridionalis и Microtus mystacinus
- Ася Давидьян (Санкт-Петербургский государственный университет). Геномная организация 5S рРНК генов у позвоночных животных
- Гузель Давлетшина (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Секвенирование полных митохондриальных геномов белуг из археологических раскопок Поволжья
- Александр Демин (Санкт-Петербургский государственный университет). Организация межгенного спейсера рибосомной днк (IGS) у птиц
- Ольга Козлова (Казанский федеральный университет). Транскриптомика уха регенерирующих иглистых мышей Acomys Cahirinus на уровне единичных клеток
- Светлана Романенко (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Хромосомные перестройки в эволюции генома нильского крокодила (Crocodylus niloticus, Crocodylidae, Reptilia)
- Мария Тихонова (Научно-исследовательский институт нейронаук и медицины). Модуляция экспрессии генов, связанных с нейровоспалением, аутофагией и нейродегенерацией, в мозге у мышей, вызванная центральным введением амилоида-бета
- Екатерина Тишакова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Идентификация предковых синтенных блоков и половых хромосом у йеменского хамелеона (Chamaeleo calyptratus, Iguania, Reptilia)
Медицинская геномика
- Виктория Арзуманян (Институт биомедицинской химии им В.Н. Ореховича). Оценка гетерогенности транскриптомов печеночных клеточных линий
- Евгений Журавлев (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Высокопроизводительное секвенирование для изучения малых ядрышковых РНК в клетках аденокарциномы легких человека A549 в условиях заражения вирусом гриппа A
- Алия Зарипова (Институт биохимии и генетики УФИЦ РАН). Применение технологии секвенирования следующего поколения для поиска патогенных мутаций у пациентов с незавершенным остеогенезом
- Александра Захаренко (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Изменение экспрессии генов в клетках НЕК293А дикого типа и нокаутных по белкам tdp1 и parp1 под действием противоопухолевых препаратов
- Ирина Ишина (Институт биоорганической химии РАН). Поиск новых аутоантигенов, связывающихся с главным комплексом гистосовместимости второго класса человека при аутоиммунных патологиях
- Иван Киселев (НМИЦ кардиологии им. ак. Е.И. Чазова). В поисках генов-модификаторов гипертрофической кардиомиопатии: данные профилирования транскриптома и полногеномного анализа метилирования ДНК
- Максим Козин (НМИЦ кардиологии им. ак. Е.И. Чазова). Различия в экспрессии генов в мононуклеарных клетках крови при радиологически изолированном синдроме и рассеянном склерозе по данным транскриптомного профилирования
- Елена Колегова (НИИ онкологии Томского НИМЦ). Особенности мутационного ландшафта рака полости рта у молодых пациентов
- Антон Кутихин (НИИ комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний). Дифференциальная регуляция транскрипционных факторов KLF2 и KLF4 в колониеформирующих эндотелиальных клетках и эндотелиальных клетках коронарной артерии человека
- Яков Ломакин (Институт биоорганической химии РАН). Аутоиммунная нейродегенерация вызывает смещение репертуара в-клеточных рецепторов
- Максим Меняйло (НИИ онкологии Томского НИМЦ). Гетерогенность циркулирующих эпителиальных клеток при раке молочной железы: идентификация опухолевых и гибридных клеток
- Александр Осадчук (Институт цитологии и генетики СО РАН). Генетическая диссекция сперматогенеза в мультиэтнических российских популяциях на основе полно-экзомных технологий
- Марина Патышева (НИИ онкологии Томский НИМЦ). Транскриптомный профиль моноцитов периферической крови при раке молочной железы человека в динамике проведения предоперационной химиотерапии
- Алина Савкова (Федеральный Исследовательский Центр Фундаментальной и Трансляционной Медицины). Анализ герминальных мутаций у пациентов с первично-множественными злокачественными новообразованиями в комбинации рак молочной железы и/или яичников
- Наталья Стефанова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Изменения транскриптомов коры мозга и гиппокампа крыс OXYS в ранний постнатальный период как предпосылка развития признаков болезни Альцгеймера
- Екатерина Трифонова (Томский НИМЦ). Паттерны альтернативного сплайсинга в децидуальных клетках плаценты при физиологической беременности
- Анна Хозяинова (НИИ онкологии Томский НИМЦ). Мутационный профиль немелкоклеточного рака легкого с высоким риском метастазирования и рецидивирования
- Матвей Цыганов (Томский национальный исследовательский медицинский центр РАН). Мутации гена PALB2 в опухоли молочной железы: связь с эффективностью неоадьювантной химиотерапии и прогнозом заболевания
- Мария Борисова (ООО «ДНК-Дисплей»). Разработка системы для преимплантационного генетического тестирования хромосомных анеуплоидий (ПГТ-А) методом массового параллельного секвенирования