Рассеянный склероз (РС) – заболевание человека, проявляющееся, в основном, в молодом возрасте, характеризующееся повреждением или утратой миелиновой оболочки нейронов центральной нервной системы и ведущее к инвалидности. Диагностика РС затруднена из-за разной степени и частоты проявления симптомов у больных, их периодичности с последующей ремиссией или постепенном прогрессировании, а также из-за того, что симптоматика может быть схожа с другими заболеваниями. Среди возможных причин развития РС рассматриваются аутоиммунная реакция, инфекция или генетическая предрасположенность [1].
С целью определения ключевых компонентов путей сигнальной трансдукции, играющих важную роль в формировании РС, проведен анализ восьми выборок микрочиповых данных из базы данных GEO(www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) с применением платформы BioUML (http://www.biouml.org). В результате мета-анализа были выявлены гены со значимо повышенной или пониженной по сравнению с контролем экспрессией, которые классифицировались по системе GeneOntology (биологические процессы), том числе, в категории «воспаление», «апоптоз», «иммунные реакции». Классификация по биологическим путям показала принадлежность выявленных генов, в том числе, к HIF1, Fas, TNFR1, p53 путям, регулирующим воспаление и апоптоз. В ходе промоторного анализа обнаружены транскрипционные факторы, регулирующие эти гены, а на следующем этапе – ключевые белки-ферменты, контролирующие активность выявленных факторов. Таким образом, проведенный анализ позволил реконструировать клеточные пути передачи сигнала, демонстрирующие значимые отличия в активности у больных РС по сравнению с нормой.
Abstracts file: | Шарипов Р.Н._тезисы.pdf |
Full text file: | Шарипов Р.Н и соавт..pdf |