Программа

Перечень лекций Школы:

1. Ming Chen / Мин Чень, профессор, Университет Чжэцзян, Ханчжоу, Китай
   Non-coding RNAs and Their Integrated Networks
2. Ming Chen / Мин Чень, профессор, Университет Чжэцзян, Ханчжоу, Китай
   Genome-wide Multiple-level Integrated Biological Network of Rice
3. Ming Chen / Мин Чень, профессор, Университет Чжэцзян, Ханчжоу, Китай
   Plant Omics Integration and Analysis Platform for Molecular Breeding – A Case Study
4. Афонников Дмитрий Аркадьевич, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Автоматическое фенотипирование растений
5. Бадаева Екатерина Дмитриевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Хромосомный анализ в структурно-функциональных исследованиях генома растений
6. Землянская Елена Васильевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Метаанализ транскриптомных данных
7. Перик-Заводский Роман Юрьевич, НИИФКИ, Новосибирск, Россия
   Интегративный анализ данных транскриптома и протеома единичных клеток при помощи метода Seurat Weighted Nearest Neighbors
8. Ломзов Александр Анатольевич, ИХБФМ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Моделирование пространственной структуры белков методом молекулярной динамики
9. Патрин Максим Михайлович, ООО “Феномика”, Москва, Россия
   Феномная селекция растений. Обзор технологий и действующие решения в России
10. Казанцев Федор Владимирович, , ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
    Потоковое моделирование метаболических систем и процессов
11. Киселёва Антонина Андреевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
    Методы геномного редактирования растений
12. Клименко Александра Игоревна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
    Биоинформатический анализ метагеномных данных, полученных с помощью секвенирования случайных фрагментов методом дробовика (shotgun метагеномика)
13. Макарова Аэлита Алексеевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
    Биологические базы данных для построения генных сетей
14. Самсонова Мария Георгиевна, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия
    Геномная селекция
15. Фишман Вениамин Семенович, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
    Методы искусственного интеллекта в науках о жизни

Перечень практических занятий Школы:

1. Сидорчук Юрий Владимирович, Маренкова Татьяна Владиславовна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Методы доставки генетических конструкций в клетки для редактирования генома растений (12 часов: три этапа по 4 часа каждый)
   
2. Патрин Максим Михайлович, ООО “Феномика”, Москва, Россия
   Гиперспектральный и мультиспектральный анализ растений. Портативные камеры MUSES-9HS, Phenocheck (Spectricon, Греция) (2 часа)
   
3. Самсонова Мария Георгиевна, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия
   Геномная селекция (2 часа)
4. Долгих Владислав Андреевич, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   От мотивов связывания транскрипционных факторов к экспрессии генов. Что можно узнать из данных ChIP-seq эксперимента (6 часов)
5. Клименко Александра Игоревна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   – практика 1: Shotgun метагеномика: таксономический анализ (2 часа)
   – практика 2: Shotgun метагеномика: функциональный анализ (2 часа)
6. Фишман Вениамин Семенович, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Аннотация геномов при помощи трансформера GENA (1,5 часа)
7. Казанцев Федор Владимирович, , ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Потоковое моделирование метаболических систем и процессов (6 часов)
8. Макарова Аэлита Алексеевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Реконструкция генных сетей методом программного комплекса ANDVisio (3 часа)
9. Вензель Артур Сергеевич, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
   Компьютерный анализ и дизайн пространственных структур белков (4 часа)