Подробная научная программа Школы – файл
Краткое табличное расписание Школы: английская версия, на русском языке.
Перечень лекций Школы:
- Ming Chen / Мин Чень, профессор, Университет Чжэцзян, Ханчжоу, Китай
Non-coding RNAs and Their Integrated Networks - Ming Chen / Мин Чень, профессор, Университет Чжэцзян, Ханчжоу, Китай
Genome-wide Multiple-level Integrated Biological Network of Rice - Ming Chen / Мин Чень, профессор, Университет Чжэцзян, Ханчжоу, Китай
Plant Omics Integration and Analysis Platform for Molecular Breeding – A Case Study - Афонников Дмитрий Аркадьевич, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Автоматическое фенотипирование растений - Бадаева Екатерина Дмитриевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Хромосомный анализ в структурно-функциональных исследованиях генома растений - Землянская Елена Васильевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Метаанализ транскриптомных данных - Перик-Заводский Роман Юрьевич, НИИФКИ, Новосибирск, Россия
Интегративный анализ данных транскриптома и протеома единичных клеток при помощи метода Seurat Weighted Nearest Neighbors - Ломзов Александр Анатольевич, ИХБФМ СО РАН, Новосибирск, Россия
Моделирование пространственной структуры белков методом молекулярной динамики - Патрин Максим Михайлович, ООО “Феномика”, Москва, Россия
Феномная селекция растений. Обзор технологий и действующие решения в России - Казанцев Федор Владимирович, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Потоковое моделирование метаболических систем и процессов - Киселёва Антонина Андреевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Методы геномного редактирования растений - Клименко Александра Игоревна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Биоинформатический анализ метагеномных данных, полученных с помощью секвенирования случайных фрагментов методом дробовика (shotgun метагеномика) - Макарова Аэлита Алексеевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Биологические базы данных для построения генных сетей - Самсонова Мария Георгиевна, Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург, Россия
Геномная селекция - Фишман Вениамин Семенович, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Методы искусственного интеллекта в науках о жизни
Перечень практических занятий Школы:
- (1) Сидорчук Юрий Владимирович, Маренкова Татьяна Владиславовна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Методы доставки генетических конструкций в клетки для редактирования генома растений (12 часов: три этапа по 4 часа каждый)
- (2) Патрин Максим Михайлович, ООО “Феномика”, Москва, Россия
Гиперспектральный и мультиспектральный анализ растений. Портативные камеры MUSES-9HS, Phenocheck (Spectricon, Греция) (2 часа)
- (4) Долгих Владислав Андреевич, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
От мотивов связывания транскрипционных факторов к экспрессии генов. Что можно узнать из данных ChIP-seq эксперимента (6 часов) - (5) Клименко Александра Игоревна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
– практика 1: Shotgun метагеномика: таксономический анализ (2 часа)
– практика 2: Shotgun метагеномика: функциональный анализ (2 часа) - (6) Фишман Вениамин Семенович, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Аннотация геномов при помощи трансформера GENA (1,5 часа) - (7) Казанцев Федор Владимирович, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Потоковое моделирование метаболических систем и процессов (6 часов) - (8) Макарова Аэлита Алексеевна, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Реконструкция генных сетей методом программного комплекса ANDVisio (3 часа) - (9) Вензель Артур Сергеевич, ФИЦ ИЦиГ СО РАН, Новосибирск, Россия
Компьютерный анализ и дизайн пространственных структур белков (4 часа)