Протеомика, метаболомика и компьютерная фармакология

Со-председатели секции: Проф. Николаев Е.Н. (Институт энергетических проблем химической физики РАН, Москва, Россия); Проф. Ларина И.М. (ГНЦ РФ Институт медико-биологических проблем РАМН, Москва, Россия), Шварц Елена (Университет Джона Хопкинса/Ariadne Diagnostics, США)

В этой сессии вопросы сфокусированы на биомаркерах и на основанных на “омик”-технологиях cстратегиях выявления биомаркеров и фармакологических мишеней при различных заболеваний. Растущий объем данных, генерируемых экспериментальными методами, бросает вызов проблему для исследователей — как извлечь из этих данных биологически применимую информацию. Новые вычислительные методы анализа данных улучшают качество потенциальных биомаркеров тем, что предоставляют пути для более эффективной верификации и валидации биомаркеров. Системная биология и анализ метаболических путей могут стать ключом, который необходим исследователям для быстрого обнаружения, определения и выбора соответствующих биомаркеров до того, как потребуются крупные денежные расходы для их разработки. Кроме того, сложные взаимодействия интересующих биомаркеров могут быть отображены на разнообразных клеточных процессах и заболеваниях для того, чтобы предоставить обзор потенциальных рисков и положительных эффектов до и во время клинических испытаний. Это позволяет компаниям максимально направить свои ресурсы на развитие целевых и индивидуальных методов лечения. В настоящее время доступен набор программного обеспечения, который обеспечивает исследователям гибкость в импорте своих экспериментальных данных профилирования, поиске в этих данных ключевых регуляторов, которые могут быть биомаркерами, а также хранении этой информации в поисковых базах данных. Эта инновационная технология особенно подходит для выявления новых биомаркеров различных заболеваний в области персонализированной медицины. С помощью протеомики или данных из других «омик»-технологий выбираются биологические пути, которые тесно связаны с интересующим клиническим исходом. Используется своя обширная база данных информации касательно путей, содержащая данные по отношениям между белками, клеточным процессами, малым молекулами, и др. Таким образом, вычислительные подходы точной медицины вместе с появлением новых высокопроизводительных технологий поиска биомаркеров предоставляют возможность комплексного профилирования новых биологических путей и молекулярных мишеней, которые могут быть более специфическими индикаторами многих тяжелых заболеваний, включая рак и нейродегенеративные болезни.
Темы секции включают, но не ограничиваются следующими:

  • Роль протеомики в клинической фармакологии
  • Биомаркеры: биоинформатическая/математическая точка зрения
  • Биомаркеры в трансляционной медицине
  • Фармакология рака
  • Протеомика в нейронауках
  • Вычислительные подходы к разработке суррогатных биомаркеров для клинических испытаний