Семенычев А.В. Суслов В.В. Timonov V.S.
Визуальное моделирование экологических систем: программная система E.N.O.T.
Докладчик: Семенычев А.В.
ВИЗУАЛЬНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ ЭКОЛОГИЧЕСКИХ СИСТЕМ: ПРОГРАММНАЯ СИСТЕМА E.N.O.T.
А.В. Семенычев 1,*, В.В. Суслов 1,2, В.С. Тимонов 1,2,3
1 Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск, Россия
2 Новосибирский государственный университет, Новосибирск, Россия
3 Сибирский государственный университет телекоммуникаций и информатики, Новосибирск, Россия
e-mail: vtimonov@bionet.nsc.ru
*Докладчик
Ключевые слова: компьютерная система, моделирование экосетей, экосистема
Компьютерное визуальное моделирование сложных биологических систем стало возможным со стремительным развитием вычислительной техники.
Сетевое моделирование в совокупности с онтологическим подходом послужило основой для анализа различных систем реального мира (молекулярно-генетические, социальные и др.), предоставляя гибкие возможности описания и представления объект-объектного взаимодействия.
Актуальным направлением является моделирование экологических систем. Оно включает в себя задачи, связанные с описанием систем, их анализом и прогнозированием поведения в рамках естественного и антропогенного воздействий.
В 2006 году в ИЦиГ СО РАН были предложены концептуальные онтологии для описания макро- и микродинамики экосистем [1]. Прямое перенесение онтологий в компьютерную систему было невозможным из-за комплексного характера реконструкции. Исследователями было создано универсальное компьютерное описание предметной области для реконструкции сетевых моделей экосистем, основанное на концептуальных онтологиях [2].
В настоящий момент нами разрабатывается веб-ориентированная система E.N.O.T. (Ecological Networks Online Tool), предоставляющая исследователям интерактивные средства для реконструкции и анализа сетевых моделей различных экологических систем. Система E.N.O.T. включает в себя БД элементов и моделей, а также платформенно-независимый клиент с богатыми WYSIWYG возможностями, запускаемый в веб-браузере. В рамках E.N.O.T. будут решаться задачи, как научно-исследовательского, так и образовательного характера. Ключевой особенностью системы является гибкое расширение базового описания предметной области, относительно конкретной задачи, которое проводится без участия IT-специалиста.
Работа поддержана интеграционным проектом СО РАН № 50 «Модели изменения биосферы на основе баланса углерода (по натурным и спутниковым данным и с учетом вклада бореальных экосистем)».
Литература:
1. Сергеев М. Г., Суслов В. В., Мигинский Д. С. и др. Опыт создания базы данных для описания экосистем с использованием сетевых технологий // Биоразнообразие и динамика экосистем / под ред. Шумный В.К., Шокин Ю.И., Колчанов Н.А., Федотов А.М. Новосибирск, 2006. C. 95–116.
2. Тимонов В.С., Суслов В.В., Брянская А.В. и др. Подход и программные средства для описания макро- и микродинамики экосистем // Вестник НГУ, серия: Информационные технологии. Т.9. Вып. 1. Новосибирск, 2011. С. 38-43.