Информационное письмо

Глубокоуважаемые коллеги, дорогие друзья!

С 16 по 22 июля 2006 года Институт цитологии и генетики СО РАН проводит традиционную — пятую по счету — Международную конференцию по биоинформатике регуляции и структуры генома (BGRS’2006).

Тематику BGRS’2006 составят вопросы развития нового поколения методов компьютерного и теоретического анализа и их приложения к задачам структурно-функциональной организации геномов, транскриптомики, протеомики, метаболомики, эволюционной и системной биологии. На конференции будут представлены новейшие исследования в этих областях науки, и участники получат прекрасную возможность продемонстрировать и обсудить свои работы.

Приглашаем принять участие в конференции ученых, чьи научные интересы лежат в области биоинформатики, математической, теоретической и/или компьютерной биологии, и ученых, занятых экспериментальными исследованиями и использующих в своей работе теоретические и/или компьютерные методы.

Будем рады видеть среди участников и представителей промышленных кругов из биотехнологических и фармацевтических компаний и фирм.

Надеемся, что вы сможете участвовать в конференции, и постараемся сделать ваш визит в Новосибирск приятным и плодотворным.

Организаторы конференции

Связаться с организаторами можно по адресу bgrs2006@bionet.nsc.ru

Участники конференции регистрируются на АНГЛОЯЗЫЧНОЙ странице сайта.
Рабочий язык конференции английский.

Важные даты:

  • Срок подачи тезисов (объем до 4-х страниц) — до 30 марта 2006 г.
  • Уведомление о принятии тезисов к опубликованию и включении сообщения в программу конференции — до 1-го мая 2006 г
  • Регистрация участников на сайте конференции — до 15 мая 2006 г.
    Как и на предыдущих конференциях, программой BGRS’2006 предусмотрены пленарные лекции, устные сообщения, специализированные стендовые сессии, компьютерные демонстрации, демонстрации программного обеспечения, круглые столы.Научная программа BGRS’2006 включает следующие темы:

    • КОМПЬЮТЕРНАЯ СТРУКТУРНАЯ И ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ГЕНОМИКА:
      Крупномасштабный анализ и сравнение геномов; функциональная аннотация геномов, выявление и предсказание структуры генов; базы знаний и онтология; мобильные генетические элементы и повторенные последовательности ДНК; нуклеосомная организация ДНК; регуляторные геномные последовательности (базы данных и базы знаний, компьютерный анализ, распознавание и моделирование); экспрессия генов (модели транскрипции, сплайсинга и контроля трансляции); предсказание структуры генов (сайтов инициации транскрипции и трансляции, сигналов сплайсинга и полиаденилирования), а также кодирующего потенциала генов и геномов);

    • СТРУКТУРНАЯ КОМПЬЮТЕРНАЯ БИОЛОГИЯ:
      Структурно-функциональная организация РНК (анализ и предсказание); антисмысловые транскрипты и РНК-РНК взаимодействия; структурный и функциональный анализ белков, моделирование и предсказание структуры и функции белков; классификация структурных мотивов в белках и фолдинг; анализ пространственной структуры белков; функциональные сайты и активные центры в 3-х-мерной структуре (распознавание и моделирование функции); крупномасштабный анализ протеом и белок-белковых взаимодействий; молекулярная динамика ДНК, РНК и белков;

    • КОМПЬЮТЕРНАЯ СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ:
      Генные сети, пути передачи сигналов, метаболические пути, пути экспрессии гена (базы данных и базы знаний, компьютерный анализ, математическое моделирование и симуляция); математические алгоритмы управления функциями генных сетей и метаболических путей; решения обратных задач для генных сетей и метаболических путей; компьютерные алгоритмы метаболической инженерии; In silico реконструкция генных сетей на основе компьютерной обработки данных микроаррэй-анализа; описание и моделирование внутриклеточной динамики; моделирование межклеточных взаимодействий; виртуальная (электронная) клетка; генные сети и онтогенез; системная биология и биотехнология; эпигенетика; интеграция генетических, функциональных и молекулярных данных в генные сети и метаболические пути; компьютерные модели генетического контроля сложных фенотипических признаков по результатам анализа сложных генетических признаков; моделирование морфогенеза;

    • КОМПЬЮТЕРНАЯ ЭВОЛЮЦИОННАЯ БИОЛОГИЯ:
      Генетическое разнообразие (SNPs, гаплотипы, и т.д.); крупномасштабные перестройки генома; геномный полиморфизм; молекулярная эволюция (гены, геномы, регуляторные системы, метаболические пути); реконструкция эволюционных событий молекулярного уровня, построение эволюционных сценариев (модели, алгоритмы и анализ биологических примеров); эволюция генетических макромолекул и генных сетей; сравнительная геномика: регуляторные районы и кодирующие части генов; эволюция структуры и функции белков; реконструкция филогенетических деревьев; горизонтальный перенос генетической информации; теоретические и компьютерные подходы к анализу и эволюции сложных систем (генных сетей, метаболических путей, путей передачи сигналов и др.);

    • БИОМОЛЕКУЛЯРНЫЕ СИСТЕМЫ И ПРОЦЕССЫ: АНАЛИЗ ДАННЫХ И ПРОДУКЦИЯ ЗНАНИЙ
      Компьютерные технологии продукции знаний; накопление, хранение и анализ данных в геномике, транскриптомике, протеомике, системной биологии; алгоритмы и методы извлечения информации из биологических текстов; нейроинформатика; интерактивные связи между биоинформатикой и экспериментальными исследованиями в области функциональной и структурной геномики, транскриптомики и метаболомики (анализ экспрессии генов с помощью микрочипов и другие новые технологии и методы); хранение информации получение знаний, извлечение данных и машинное обучение в области геномики и протеомики; сверхбольшие компьютерные системы в молекулярной биологии и молекулярной генетике; высокопроизводительные вычисления в функциональной и структурной геномике транскриптомике, протеомике, системной биологии; методы организации данных и систем; интеграция баз данных и процессов обработки данных; визуализация данных; стохастическое моделирование; современные методы алгоритмического и программного решения задач биоинформатики; методы верификации математических моделей; анализ и моделирование биологических процессов на разных масштабах времени и уровнях организации; считывание, анализ и визуализация данных геномики, протеомики и анализа с помощью микрочипов; биоинформационные ресурсы для биотехнологии; методы и подходы в программировании алгоритмов и моделей биоинформатики, связанные с параллельными вычислительными системами и грид-технологиями; аналогии и связи моделей биоинформатики с методами распознавания образов, моделями смысл-текст в лингвистике и с моделированием цветного зрения.

    • БИОИНФОРМАТИКА И ОБРАЗОВАНИЕ